黑面琵鷺長的很像可能混群的白琵鷺，但與白琵鷺比較，黑面琵鷺的體型稍小一點（也是琵鷺家族中體型最小的），且面部黑色裸露皮膚延伸至眼睛後方。腳黑色。繁殖期時，黑面琵鷺的冠羽和胸前的羽毛有明顯的黃色。亞成鳥喙部顏色較淺，較小且表面較為平滑，初級飛羽末端外緣及飛羽羽軸皆呈黑色。
本性機警，生活於河口、潮池、濕地或潮間帶，具群居性，偶爾會與警戒性較高的水鳥聚在一起；主要在濕地或魚塭等淺水域覓食，以喙微張並在水裡掃動的方式搜尋魚蝦或甲殼類。休息時會出現嬉戲的行為，同伴間會互相理羽。
黑面琵鷺於中國大陸、澳門、香港、日本、台灣、越南、泰國等地越冬（當中台灣為世界最大度冬區。其中，臺灣占全世界數量約六成，而臺南地區以曾文溪口總數佔臺灣的9成，促使當地設有台江國家公園等保護區。度冬時會在嘉南高雄濱海各濕地地間移動，另外宜蘭則有小群度冬群體。春季北返季則會在沿途的彰化、新竹、新北等境內濕地短暫休整，此時有多數轉成金黃繁殖羽的個體，相當漂亮。
近年曾有鳥友募資購買魚苗放流黑琵較常造訪的濕地，吸引黑琵大軍駐留覓食，算是人鳥和諧的成功案例。
混群的黑面琵鷺與白琵鷺辨識區別圖：
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